任务（Missions）是指《全境封锁》中各种指派予特工的工作，一般分为故事任务、支线任务以及随机遭遇任务。另外于更新 1.1：袭击当中新增了每日任务和每周任务以供特工们取得各式奖励。
任务可分为三大类: 医疗，科技和防御。
这些任务记载于特工的任务日志中，玩家可以透过完成这些任务来解锁行动基地中的技能。目前至少有15个主要战役任务和15个支线任务，有些更可通过免费或付费下载内容进行添加。
故事任务[]
故事任务是指《全境封锁》当中的故事主线，当中主要存在于曼克顿中，每一个主线任务皆会触发某些情节。指派予特工的故事任务可分为三大类: 医疗任务，科技任务和防御任务。详细分类请参看故事任务。
支线任务[]
支线任务是另一类的任务，为非主线故事的相关任务，完成后可获得经验值等。支线任务可以透过各区域的安全藏身处的各位联合作战部队军官中解锁，然后就可以在地图上看到。详情请参阅支线任务。
遭遇任务[]
遭遇任务遍布于地图每一个区域的各处，可以于各个安全藏身处的情势概况板中解锁，然后就可以在地图上看到。主要为各位特工提供行动基地各支部升级用之支部补给品。详情请参阅遭遇任务。
袭击任务[]
袭击任务是《全境封锁》DLC中的追加任务。只有等级30以及解开全主线任务之特工才可以进入，主要提供强力装备组之装备。详看袭击任务。
每日任务[]
每日任务由国土战略局于港台时间每天早上08:00指派3项事宜予各特工，任务为非强制性的，但任务时限只有24小时。各位特工可以选择放弃或执行以赚取更多奖励。详情请参阅每日任务。